Construction de la carte génétique de l’érable à sucre

Ghanem, Rania Yousra (2026). Construction de la carte génétique de l’érable à sucre. Mémoire. Gatineau, Université du Québec en Outaouais, Département des sciences naturelles, 81 p.

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Résumé

L’érable à sucre (Acer saccharum Marsh.) est l’une des espèces les plus importantes sur le plan écosystémique de l’est de l’Amérique du Nord. Malheureusement, elle est soumise à divers stress biotiques et abiotiques, notamment les changements climatiques, qui nuisent à sa croissance et compromettent sa pérennité à long terme. Afin de mieux comprendre son potentiel adaptatif face à ces perturbations, des études ont été menées sur sa diversité génétique, en vue de projets d’amélioration génétique. Toutefois, A. saccharum a fait l’objet de peu de travaux sur ce sujet, en raison de l’absence d’outils indispensables, tels qu’une carte de liaison génétique. Cette carte permet notamment d’aider à localiser des gènes d’intérêt, faciliter et accélérer les projets d’amélioration génétique. Étant une espèce allogame, A. saccharum ne se prête pas aux stratégies classiques de cartographie, ce qui explique en partie l’absence de carte de liaison génétique de cette espèce. Dans cette présente étude, nous avons utilisé 11 locus microsatellites afin d’identifier 148 individus (full-sib) issus d’une descendance F1 à pollinisation libre dans une plantation d’A. saccharum. Nous avons ensuite appliqué l’approche de séquençage par génotypage, pour détecter des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), génotyper cette fratrie et identifier 3 684 SNP. Ces marqueurs ont servi à l’inférence des génotypes des parents inconnus, une étape essentielle à la construction de la carte génétique. La carte génétique obtenue comprend 13 groupes de liaison génétique correspondant à la taille du génome haploïde de l’espèce, avec une longueur totale de 11 558,05 cM, une densité moyenne de 0,08 SNP/cM et une distance moyenne de 12,16 cM entre SNP. Cette carte couvre 93,67 % du génome de référence. La comparaison entre la carte génétique et le génome de référence d’A. saccharum a révélé une synténie moyenne de 97,19 % et une colinéarité significative. Cette première carte représente un outil intéressant pour de futures études, notamment pour améliorer l’assemblage du génome et pour des projets d’amélioration génétique en facilitant la détection de QTL d’intérêt, tels que ceux associés au rendement en sucre.

Type de document:	Thèse (Mémoire)
Directeur de mémoire/thèse:	Groba, Yann Surjet
Mots-clés libres:	Acer saccharum Marsh.; Microsatellites; GBS; Carte de liaison génétique
Départements et école, unités de recherche et services:	Sciences naturelles
Date de dépôt:	12 févr. 2026 20:19
Dernière modification:	12 févr. 2026 20:19
URI:	https://di.uqo.ca/id/eprint/1887

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